TLS se kombinuje s aplikačními protokoly tam, kde se používal nebo ještě používá SSL. Např. ve Windows Server 2003 to jsou:

• smtp, imaps, pop3s - pošta
• https - stránky
• nntps - dikusní skupiny
• ldaps - adresářové služby
• ftps-data, ftps - přenos souborů
• telnets - vzdálený terminál
• ms-sql-s - SQL server
• tftps - nespojované ftp

Asi nemá cenu blíže rozebírat jednotlivé protokoly. Jedná se o zabezpečené verze známých aplikačních protokolů.

Zmínil bych zde ale ještě použití TLS ve WLAN. Zde jsou spojení vytvořena pomocí PPP (spojení mezi dvěma zařízeními). Pro autentizaci se používá EAP-TLS. RFC je sice označen jako experimentální, ale v praxi se používá. Byl zvolen i ve Windows XP. Jeho rozšířená modifikace je EAP-TTLS, která navíc vytvoří tunel pro druhý ověřovací algoritmus.

TLS lze rovněž použít ke komunikaci ve virtuálních privátních sítích VPN. Zde používá jako levnější náhrada za IPsec. Příkladem konkrétní implementace je OpenVPN.